Két módon történhet: kólititer vagy kóliszám alapján. A kólititer az a víztérfogat, amelyből kólibaktérium már kitenyészthető, a kóliszám pedig a 100 cm3 vízből kitenyészthető telepek számát jelenti.
A felszíni vizek minősítésével az MSZ12749:1993 szabvány foglalkozik, ez tartalmazza a különböző komponensek határértékeit az ötosztályos minősítő rendszerben. A kémiai, biológiai és bakteriológiai vízminősítés alapján határozzuk meg egy adott víz vízminőségi osztályát. Az I. osztály (kiváló) vízminőségi térképeken kékkel van jelölve, a II. osztály (jó) zöld, a III. osztály (tűrhető) sárga, a szennyezett piros, az erősen szennyezett vizek pedig feketével vannak jelölve.[1]
[1] A Duna szennyezettsége ellenére, még mindig Európa egyik legtisztább folyójának számít. Benne még sokan fürdenek, és partjain még eredményes horgászélet folyik. Mindez már nem mondható el a legtöbb nyugat-európai folyóról, amelyekben halak már rég nincsenek és a fürdőzés bennük már igazán nem ajánlatos.
