Ugyancsak mezőgazdasági műveléssel kerülnek a talajba a műtrágyák. Alkalmazott mennyiségük Európában a 80-as, 90-es években érte el a maximumot, azóta a kiszórt műtrágyák mennyisége jelentősen mérséklődött Magyarországon is. Káros hatásuk elsősorban a vízszennyezésben nyilvánul meg (lásd ott), mindamellett, hogy hosszú távú alkalmazása nem is indokolt.
pétisó
( forrás: http://nagyalfold.hu/ )
A műtrágyák további hatásai a talajra egyértelműen károsak: egy-egy ion vagy vegyület nagy koncentrációban kerül be, elkeveredésük a talajjal gócos, növelik a talaj sókészletét, a növények számára nem szükséges anyagok is előfordulnak bennük, és megváltoztat(hat)ják az oldhatósági viszonyokat és a pH-t.